和波拿巴家族中的其他人不同，约瑟夫现在安全地隐居在巴黎，全力置办莫尔丰塔尼的家产。因为尽管他在罗马时间不长，却绝不是空手而回。他置办地产就花去了25万法郎，此后8๖年他又置办了一些地产，加上室内装修、家具和其他用度，花费相当惊人。
随着拿破仑和西哀士的关系得到确定，他们私下不能再多接触，罗德雷继续充当他们之间的传声筒，同时，欧shubຘaoinfo仁·博阿尔内则通过军中的熟人控制ๆ巴拉斯。警察局长富歇两面讨好，通过雷亚尔为拿破仑工作，同时秘密地向巴拉斯透露有关推翻他和督政府的政变的计划。但是，富歇和巴拉斯都没有决定采取行动，显然是感到自己้没有力量和拿破仑抗衡。出于对戈耶和穆兰的反感，巴๒拉斯和富歇自然不愿意向他们透露拿破仑的秘密计划。
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曾经向拿破仑表示ิ要全力支持埃及远征的塔列朗给督政府的特雷亚尔treilhard写信，后者将该信于1798๖年11้月4r转寄给了拿破仑并批写道：“你可以想像督政府是多么เ后悔，以及他们是多么เ难以理解你远征的详情。”他继续写道，“由á于海战的失败，法国在地中ณ海处于腹背受敌的窘境。一切国际问题皆应归咎于这个ฐ可怕的事件。”这次“舰队的灾难”削弱了法国各种外j政策的基础。马耳他遭到เ封锁、意大利ำ出现麻烦、英国和奥地利联合俄国和普鲁士正在形成新า的反法同盟。此外，督政府不得不紧急征募20万新兵，由儒贝尔将军前去担任意大利ำ军司令，儒尔当将军整编莱茵军。特雷亚尔强调，如果战争爆发，肯定是爆发在意大利无疑ທ。尽管如此，“外部之敌终将被征服……通过政府所有成员团结一致，坚强无比的、不朽的共和国将战胜一切敌人……因此，你必须准备完全依靠你自己的力量，至少在一段时间内是如此。”最后特雷亚尔督政指出拿破仑有3种选择：他可以留在埃及等待时机；他可以进军印度；或者，他可以进军君士坦丁堡。最后，他对几个ฐ月前曾在他面前出言不逊的拿破仑挖苦道：“无论你做何决策，我们期待靠你的天才和运气；你最后能力挽千钧，取得辉煌ä胜利ำ。”特雷亚尔以及明显参与起草此信的塔列朗终于也许不是最后看到了拿破仑的笑话。收信人拿破仑直到เ179๗9年3๑月25r在阿克再次遭到军事挫折时才收到这封信。
回过头来说，在阿布基尔海战失败后不久，8月15๓r，拿破仑的29岁生r聚会很少有喜庆的气氛；甚至他的9名副官以及他的养子欧shubaທoinfo仁·博阿尔内和愁眉苦脸的弟弟路易·波拿巴也只是敷衍了事地