第三新东京市，在多次经受使徒侵袭之后，到เ处是战斗ç遗留下来的废墟。在夕阳西沉的湖边，真嗣遇见了一位少年，他就是由áseeLe送来的第五适格者－－渚薰。经过心灵的沟通，真嗣对这位少年产生了好感，但渚薰的真实面目却是第十七使徒。他带领着二号机，来到เneRຂVຆ地下的亚当处。但在追来的真嗣面前，他却要求真嗣将他杀死……
三号机运到后，美里也前往松代指挥启动实验，但她没告诉真嗣有关东治的事。实验中，三号机失控，原因是被第十三使徒寄生Va三机出动拦截使徒，零号与二号机相继被击败。真嗣得知三号机内有驾驶员后拒绝执行任务。于是元渡命令打开初号机的模拟作战系统，将三号机撕成了碎片。当得知三号机驾驶员仍生存而稍得安慰的真嗣看到工作人员抬出了奄奄一息的东治时，他出了绝望的悲鸣。
副标题的意思是“不要因为你的个人恩怨导致别人受苦”。这句话是美里制订下与magI所不同的作战方案后，赤木律子在洗手间对美里所说的。
赤木之所以会放心的让葛城去阻止Ja，是因为她确信Ja会在爆炸前恢复正常，因为结尾她说：“除了葛城一尉的行动外，一切都照剧ຕ本进行。”也就是说，没有葛城去阻止的话，Ja一样会停止。葛城自己也说：“奇迹是被某人准备好的。”