黄巾的叛乱还在继续，大将军何进派遣的皇甫嵩和卢植以及其他官军还在镇压，此时张角已๐死公元184年病逝于冀州，张宝和张梁都被官军打败，幽州刺史郭勋、广阳太守刘卫在镇压叛军时被杀，黄巾残余部队还在抵抗之中ณ。
何进为ฦ职的大将军，率左右羽林五营士屯于都亭，整点武器，镇守京师；又自函谷关、大谷、广城、伊阙、轘辕、旋๙门、孟津、小平津等各京都关口，设置都尉驻防；下诏各地严å防，命各州郡准备作战、训练士兵、整点武器、召集义军。
皇甫嵩上谏要求解除党群，拿出皇宫钱财及西园良马赠给军士，提升士气，而吕彊又对灵帝ຓ上言：“党锢之ใ祸积怨日久，若果与黄巾合谋，恐怕已๐经无救了。汉灵帝ຓ接纳提案，在壬子日大赦党人，还各徙徒，要求各公卿捐出马匹、弓弩，推举众将领的子孙及民间有深明战略๓的人到公车署接受面试。
而另一方แ面又精兵镇压各地乱事：卢植领副将宗员率北军五校士负责北方战线，与张角主ว力周旋；皇甫嵩及朱儁各领一军，控制五校、三河骑士及刚募来的精兵勇士共四万多人，讨伐颍川ษ一带的黄巾军，朱儁又又上表召募下邳ใ的孙坚为ฦ佐军司马，带同乡里少年及募得各商旅和淮水、泗水精兵，共千多人出与朱隽军连军。庚子日，张曼成攻杀南阳郡守褚贡，响应张角。
官军在战并未得利ำ，于4๒月，朱儁军就被黄巾波才所败而撤退，皇甫嵩唯有与他一起进驻长社防守，被波才率大军围城，官军人少，士气低落。又汝南黄巾军在邵ๅ陵打败太守赵谦，广阳黄巾军杀死幽州刺史郭勋及太守刘卫，黄巾军并未因汉室的动作而有败退的迹象。
5月，京师见皇甫嵩被围，派曹操率军救援。不过援军未到时，皇甫嵩已๐心生一计，在傍晚时份吹起大风，皇甫嵩命士兵手持火把暗暗出城，利用黄巾军营寨周围的杂草，用火攻大破敌人，大呼进攻，城上亦举出火把响应，皇甫嵩以鼓助战，冲入敌阵，黄巾军大乱ກ，四处奔走。又遇上曹操的援军，被皇甫嵩、朱隽和曹操三面夹击，斩ล杀数万人，官军大胜。
6月，南阳太守秦颉้与张曼成战斗，斩ล杀了张曼成。黄巾军便改以赵弘为帅，以十多万人占据宛城。而皇甫嵩与朱隽军继续进击汝南、陈国的黄巾，追击波才到阳翟，最后在西华大败彭脱，余军想逃到宛城，但孙坚登城先入，众人蚁附般推进，大破敌军，成功讨平豫州一带的黄巾军。另一方面，卢植数战间大破张角，斩杀万多人。
张角唯有撤到เ广宗，卢植建筑拦挡、挖掘壕沟，制造